Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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