Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PHOX2BQ99453 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PHOX2BQ99453 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PHOX2BQ99453 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PHOX2BQ99453 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PHOX2BQ99453 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PHOX2BQ99453 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHOX2BQ99453 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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