Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SGCZQ96LD1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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