Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms