Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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