Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF397Q8NF99 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms