Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms