Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNNM4Q6P4Q7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CNNM4Q6P4Q7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CNNM4Q6P4Q7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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