Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC010624.1-201ENST00000527209 1525 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF682-203ENST00000397165 3245 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RHD-201ENST00000328664 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LINC01122-207ENST00000452840 4077 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 KIRREL3-201ENST00000525144 3808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FOSB-210ENST00000591858 3658 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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