Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms