Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF56Q15929 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms