Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms