Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CUL3Q13618 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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