Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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