Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms