Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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CLN3Q13286 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CLN3Q13286 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLN3Q13286 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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