Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms