Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HTRA4P83105 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HTRA4P83105 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HTRA4P83105 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms