Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL23P55773 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL23P55773 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL23P55773 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms