Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP4P49662 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms