Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK8P49336 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK8P49336 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK8P49336 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK8P49336 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK8P49336 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK8P49336 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK8P49336 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK8P49336 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms