Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms