Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GTF2E2P29084 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms