Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP11P24347 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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