Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPREP23469 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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