Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTGS1P23219 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms