Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LIG1P18858 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIG1P18858 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms