Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms