Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HKR1P10072 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HKR1P10072 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms