Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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CLDN9O95484 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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CLDN9O95484 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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CLDN9O95484 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLDN9O95484 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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