Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP104O60308 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP104O60308 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP104O60308 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms