Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms