Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ODF3BA8MYP8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms