Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.3 ms