Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMD3A2A2Y4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms