Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PALD1Q9ULE6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PALD1Q9ULE6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms