Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LHX3Q9UBR4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LHX3Q9UBR4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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