Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC180Q9P1Z9 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms