Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHST12Q9NRB3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms