Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGIP1Q9BQI5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms