Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YME1L1Q96TA2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms