Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CSRNP1Q96S65 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms