Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNFT2Q96EX2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNFT2Q96EX2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RNFT2Q96EX2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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