Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIRT1Q96EB6 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms