Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms