Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYRIPQ8NFW9 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYRIPQ8NFW9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms