Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms