Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms