Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ASB11-202ENST00000380470 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN30-211ENST00000610712 3439 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 LMOD3-203ENST00000489031 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC5A11-208ENST00000565769 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C16orf54Q6UWD8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms