Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms